เผชิญหน้า กาฬโรค มหันตภัยร้ายที่กลืนกินยุโรปในยุคกลาง การระบาดที่ร้ายแรงที่สุดในประวัติศาสตร์มนุษยชาติ เมื่อปีศาจร้ายค่อย ๆ คืบคลานเข้ามาแล้ว พวกโคนันที่มาโผล่ในยุคมืดต้องเผชิญหน้ากับภัยอันตรายที่ร้ายแรงที่สุดในประวัติศาสตร์มนุษยชาติ ขณะที่ไทม์ดริฟเตอร์กำลังเดินทางตามหาดอกเตอร์อากาสะที่แถบชานเมืองทางตอนเหนือของดินแดนเยอรมนี ในช่วงยุคกลาง พวกเธอได้ตัดสินใจพักในหมู่บ้านแห่งหนึ่ง และกำลังตื่นเต้นสุดๆ เมื่อพบว่าจะมีคณะละครสัตว์เดินทางมาทำการแสดงที่นี่ แต่พวกเธอยังไม่รู้ว่ามีภัยร้ายแสนอันตรายกำลังค่อยๆ คืบคลานเข้ามาพร้อมกันนั้นด้วย