สิ่งที่ถือกำเนิดขึ้นมาจากอาร์เซอุสก็คือ เหล่าโปเกมอนมังกรในตำนาน! ทุกคนพุ่งทะยานไปเพื่อต่อกรกับเหล่าโปเกมอนในตำนานทั้ง 3 ที่ตัวหนึ่งควบคุม "เวลา" ตัวหนึ่งควบคุม "ห้วงมิติ" และอีกตัวหนึ่งควบคุม "ปฏิสสาร" จุดประสงค์ที่แท้จริงของกลุ่มคนที่ยื่นมือเข้ามาช่วยเหลือโดยไม่คาดคิดคืออะไร!? แล้วเสียงร้องตะโกนของโกลด์ล่ะ!? เนื้อเรื่องในบทที่ 9 สุดเข้มข้นชนิดที่คุณต้องกลั้นหายใจดำเนินมาถึงตอนไคลแม็กซ์แล้ว! และแล้วความท้าทายครั้งใหม่ในเขตแดนใหม่ก็ได้เริ่มต้นขึ้น!! ส่วนฉากของเรื่องก็ได้ย้ายจากดินแดนปริศนาไปยัง "โบราณสถานชินโต"..!!!